- Šobotník J. & Svatoš A. 2001: Kutikulární uhlovodíky: Které látky jsou odpovědné za vůni termití kolonie a co lze vyčíst z jejich složení? Vesmír 80: 636-637.
- Šobotník J.: Termiti v Čechách. Výstava autorských fotografií, divadlo Komedie, 6.2004 - 30.6.2004.
- Hubert J. & Šobotník J.: Prachoví roztoči, jak je neznáme. Výstava autorských fotografií, Kulturní dům Vltavská, 23.5.-2.6.2005.
- Šobotník J., Weyda F. & Hanus R. 2005: Vibrace termitů jako poplašný signál. Živa 2005/1: 28-29.
- Hanus R. & Šobotník J. 2005: Včelí tanec jako zdroj informací. Včelařství 58 (139, 8): 213-215.
- Hanus R. & Šobotník J. 2005: Význam feromonů v životě včel. Včelařství 58 (139, 9): 233-235.
- Šobotník J. & Hanus R. 2005: Termiti (Isoptera) - (nejen) škůdci dřeva. Předneseno na odborném semináři: Poškození zpracovaného dřeva houbami a hmyzem, Praha, ČZU Suchdol, 19.9.2005.
- Žďárek J. & Šobotník J. 2007: Řeč hmyzu: ČRO Leonardo, 1.8.2007 (Hodinová živá debata na téma hmyzí komunikace a feromonů)
- Šobotník J. 2009: Složitosti termitího života. ČRO Leonardo, 25.9.2009
- Šobotník J. 2009: Život v termitišti. ČRO Leonardo, 6.10.2009
- Šobotník J. 2012: Obranné mechanismy Neocapritermes taracua. ČRO monitor, 1.8.2012 (http://www.rozhlas.cz/leonardo/priroda/_zprava/termiti-se-smrticimi-batohy--1091868)
- Šobotník J. 2012: Podzimní škola ÚOCHB – Chemická ekologie termitů: Feromony a obranné látky (26.10.2012)
- Šobotník J. 2013: Stůj nebo vybouchnu - Ekologie a evoluce obranných strategií termitů. Biologické čtvrtky ve Viničné (4.4.2013)
- Šobotník J. 2014: Naturens vildeste selvmordsbombere: Eksploderende insekter. Videnskab.dk
- Pech P. & Šobotník J. 2014: Recenze Jan Žďárek: Hmyzí rodiny a státy. Živa 2014/3: LXI.
- Málek J. (s přispěním J. Šobotníka a P. Stiblíka) 2015: Výzkum v deštném pralese. Jsou hlínožraví termiti vybíraví? Týden 3.12.2015.
- Dohnal R. & Šobotník J. 2017: Slepí požírači dřeva a hlíny. Příroda 2017 (3-4): 20-24
- Rychlík M. & Šobotník J. 2017: Sebevražední atentátníci termiti. Termiti jsou prostě nejlepší, tvrdí vědec. Lidové Noviny XXX/188, 15.8.2017, str. 1, 2.
- Šobotník J. 2017: Promítání filmu Svět podle termitů a následná debata s Markem Janáčem a Prof. Jaroslavem Petrem. Les Fest Hradec Králové, 2.12.2017 (viz zde)
- Gregušová V. 2018: „Termitům jsem úplně propadl“ Rozhovor s JŠ. 7. generace 1/2018: 57-61. (viz zde)
- Mašková M., Šobotník J., Sedláček O., Bareš I. 2018: Rozhlasová laboratoř, 7.4.2018 (viz zde)
- Šobotník J. & Vaněk R. 2018: Termit je časovaná bomba. Instinkt XVII (16): 44-47. (Rozhovor s JŠ.)
- Šobotník J. 2018: Představení nového rodu termitů, Roisinitermes. ČT24, 12.11.2018 (viz zde; čas 18:41).
- Mašková M., Šobotník J., Konvalinka J. & Brousek O. 2018: Rozhlasová laboratoř, 17.11.2018 (viz zde)
- Šobotník J. & Černá E. 2018: Termiti zaklepou na naše dveře za třicet let. Vybrané druhy mají sílu kusadel jako manikurní nůžky, říká objevitel nového druhu. Deník N, 25.11.2018 (viz zde)